Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTJ4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTJ4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTJ4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTJ4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTJ4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTJ4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTJ4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTJ4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTJ4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTJ4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTJ4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTJ4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTJ4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTJ4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTJ4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTJ4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTJ4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTJ4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTJ4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTJ4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTJ4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTJ4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTJ4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTJ4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTJ4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTJ4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTJ4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTJ4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTJ4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTJ4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3TTJ4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3TTJ4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Q3TTJ4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Q3TTJ4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3TTJ4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3TTJ4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3TTJ4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3TTJ4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3TTJ4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3TTJ4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3TTJ4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Q3TTJ4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3TTJ4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3TTJ4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3TTJ4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q3TTJ4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3TTJ4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q3TTJ4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3TTJ4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3TTJ4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3TTJ4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q3TTJ4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3TTJ4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3TTJ4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3TTJ4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q3TTJ4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3TTJ4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q3TTJ4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3TTJ4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3TTJ4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms