Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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