Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms