Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms