Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms