Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtl9Q32KG4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtl9Q32KG4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtl9Q32KG4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtl9Q32KG4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtl9Q32KG4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtl9Q32KG4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms