Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms