Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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