Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ptcd3Q14C51 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ptcd3Q14C51 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ptcd3Q14C51 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ptcd3Q14C51 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Ptcd3Q14C51 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ptcd3Q14C51 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ptcd3Q14C51 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ptcd3Q14C51 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ptcd3Q14C51 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ptcd3Q14C51 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ptcd3Q14C51 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ptcd3Q14C51 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ptcd3Q14C51 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ptcd3Q14C51 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ptcd3Q14C51 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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