Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Rpusd3Q14AI6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Rpusd3Q14AI6 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Rpusd3Q14AI6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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