Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms