Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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Traf3ip1Q149C2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Traf3ip1Q149C2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Traf3ip1Q149C2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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Traf3ip1Q149C2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Traf3ip1Q149C2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Traf3ip1Q149C2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Traf3ip1Q149C2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Traf3ip1Q149C2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Traf3ip1Q149C2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Traf3ip1Q149C2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Traf3ip1Q149C2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Traf3ip1Q149C2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Traf3ip1Q149C2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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Traf3ip1Q149C2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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