Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

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Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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VgfQ0VGU4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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VgfQ0VGU4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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VgfQ0VGU4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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VgfQ0VGU4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
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VgfQ0VGU4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VgfQ0VGU4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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