Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms