Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms