Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MitfQ08874 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MitfQ08874 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MitfQ08874 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MitfQ08874 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
MitfQ08874 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MitfQ08874 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MitfQ08874 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MitfQ08874 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms