Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms