Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms