Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms