Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sh3bp2Q06649 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sh3bp2Q06649 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sh3bp2Q06649 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sh3bp2Q06649 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sh3bp2Q06649 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sh3bp2Q06649 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sh3bp2Q06649 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sh3bp2Q06649 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Sh3bp2Q06649 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Sh3bp2Q06649 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Sh3bp2Q06649 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Sh3bp2Q06649 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Sh3bp2Q06649 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Sh3bp2Q06649 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Sh3bp2Q06649 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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