Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms