Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms