Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 9930120I10Rik-201ENSMUST00000203027 865 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms