Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ccl7Q03366 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms