Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col6a2Q02788 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Col6a2Q02788 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Col6a2Q02788 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col6a2Q02788 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col6a2Q02788 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col6a2Q02788 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col6a2Q02788 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col6a2Q02788 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col6a2Q02788 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col6a2Q02788 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col6a2Q02788 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col6a2Q02788 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col6a2Q02788 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col6a2Q02788 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col6a2Q02788 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col6a2Q02788 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col6a2Q02788 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col6a2Q02788 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms