Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms