Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pde1bQ01065 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Pde1bQ01065 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Pde1bQ01065 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Pde1bQ01065 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Pde1bQ01065 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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