Protein–RNA interactions for Protein: Q00899

Yy1, Transcriptional repressor protein YY1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yy1Q00899 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yy1Q00899 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms