Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms