Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited1P97769 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms