Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms