Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3aP97351 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms