Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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