Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx1P82976 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx1P82976 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx1P82976 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx1P82976 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx1P82976 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx1P82976 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx1P82976 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx1P82976 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx1P82976 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx1P82976 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx1P82976 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx1P82976 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx1P82976 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx1P82976 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx1P82976 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx1P82976 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx1P82976 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx1P82976 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx1P82976 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx1P82976 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms