Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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SgcdP82347 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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SgcdP82347 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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SgcdP82347 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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