Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms