Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms