Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NfixP70257 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NfixP70257 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NfixP70257 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NfixP70257 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NfixP70257 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NfixP70257 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NfixP70257 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NfixP70257 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NfixP70257 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfixP70257 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfixP70257 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfixP70257 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfixP70257 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NfixP70257 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfixP70257 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfixP70257 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NfixP70257 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NfixP70257 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfixP70257 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfixP70257 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NfixP70257 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NfixP70257 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfixP70257 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfixP70257 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfixP70257 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfixP70257 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfixP70257 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfixP70257 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfixP70257 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfixP70257 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfixP70257 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfixP70257 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NfixP70257 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NfixP70257 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfixP70257 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfixP70257 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfixP70257 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfixP70257 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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NfixP70257 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfixP70257 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfixP70257 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NfixP70257 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfixP70257 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfixP70257 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfixP70257 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfixP70257 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfixP70257 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfixP70257 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfixP70257 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfixP70257 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfixP70257 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfixP70257 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfixP70257 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfixP70257 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfixP70257 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfixP70257 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfixP70257 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfixP70257 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfixP70257 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfixP70257 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfixP70257 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms