Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba4aP68368 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms