Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpfP62307 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpfP62307 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpfP62307 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpfP62307 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpfP62307 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpfP62307 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpfP62307 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpfP62307 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpfP62307 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpfP62307 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpfP62307 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpfP62307 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpfP62307 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpfP62307 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpfP62307 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpfP62307 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpfP62307 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SnrpfP62307 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SnrpfP62307 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpfP62307 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpfP62307 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpfP62307 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpfP62307 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpfP62307 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpfP62307 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpfP62307 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpfP62307 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SnrpfP62307 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpfP62307 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpfP62307 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpfP62307 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpfP62307 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpfP62307 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpfP62307 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpfP62307 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpfP62307 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpfP62307 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpfP62307 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpfP62307 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpfP62307 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpfP62307 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SnrpfP62307 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpfP62307 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpfP62307 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpfP62307 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpfP62307 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpfP62307 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpfP62307 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpfP62307 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpfP62307 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SnrpfP62307 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpfP62307 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms