Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps18P62270 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms