Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp46P62069 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp46P62069 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp46P62069 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp46P62069 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp46P62069 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms