Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms