Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms