Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ctdsp1P58466 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp1P58466 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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