Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms