Protein–RNA interactions for Protein: P57748

Mmp20, Matrix metalloproteinase-20, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp20P57748 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Mmp20P57748 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms