Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Samsn1P57725 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Samsn1P57725 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Samsn1P57725 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Samsn1P57725 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samsn1P57725 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samsn1P57725 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samsn1P57725 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samsn1P57725 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samsn1P57725 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Samsn1P57725 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms