Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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