Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms